ACD의 DNAscope® HD duplex assay in situ hybridization은 공간 및 형태학적 정보와 조직의 유전자 재배열 / 융합을 시각화하고 정량화 할 수 있습니다. Target-specific signal을 증폭시키기 위한 독점 probe design 알고리즘을 사용하여 조직, 세포내에서 target DNA를 시각화 할 수 있는 빠르고 민감성이 높은 분석법을 만나보세요.
유전자 전위는 특정 염색체의 한 부분이 상동이 아닌 다른 쌍의 염색체 또는 동일한 염색체의 다른 부위로 옮겨질 때 발생하는 염색체 이상입니다. 이는 염색체 단편의 변이된 부분에 존재하는 유전자의 기능에 영향을 미치며, 일부는 암을 유발하는 세포의 악성 형질 전환을 유도할 수 있는 종양 유전자를 유발할 수 있습니다. DNAscope 분석은 Break-Apart를 감지하여 이러한 재배열을 식별하고 시각화하여 사용할 수 있습니다.
DNAscope의 장점
• 고가의 이미지 분석 장비(ex)confocal) 없이도 일반 광학현미경(bright field light microscope)을 사용하여 시그널 감지(chromogenic) • Probe signal 크기와 색상 대비를 최적화하여 데이터를 쉽게 해석 가능(Blue/Red signal 사용) • 기존 FISH 분석과 달리, 반복적인 서열이 없는 디자인으로 모든 DNA 표적에 대해 Probe 제작(specific) • 높은 감도와 신호 대 잡음비 보장 (background signal 최소화) • 작은 유전체 변화를 고해상도로 탐지
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Gene rearrangement 감지를 위한 DNAscope의 probe design 전략
같은 target gene으로 probe 두 개를(red, blue signal로 같은 gene의 다른 위치) 제작하여 시각화 합니다.
Negative control에서 blue signal과 red signal의 merge된 색상으로 표시됩니다(Break-Apart Event가 일어나지 않음). 그러나 positive control에서는 blue signal과 red signal 각각으로 표현됩니다.(Break-Apart Event가 발생함)
ALK 변이 : 폐암환자의 4-6% ALK 유전자의 변이를 가지고 있음
ROS1 변이: 비소세포폐암 발생 유도
NTRK1,2,3 변이 : 암세포 증식을 유도
Cancer 연구에 ACD의 DNAscope® ISH 분석의 적용을 입증한 White paper를 확인하세요
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A novel chromogenic in situ hybridization assay For high-resolution detection of DNA copy number and Structural variations Anushka Dikshit et al. 2021. |
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DNAscope를 이용하여 Sample 2의 Tumor 조직에서 ROS1의 유전자 전위을 확인하였습니다. |
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DNAscope를 이용하여 Sample 4의 Tumor 조직에서 ALK의 유전자 재배열을 확인하였습니다. |
그 밖에도 DNAscope는 DNA의 Copy-number variation 등에서도 활용될 수 있습니다.
