6월 23일에서 25일까지 개최되는

2021년 한국미생물 • 생명공학회 국제학술대회 및 정기학술대회에서

엠디엑스케이 워크샵을 진행합니다.

Shoreline Biome사의 Mark Driscoll 박사는

미숙아 분변에서의 박테리아 strain amplicon fingerprinting 관련하여

공유할 예정입니다. 

PacBio의 highly accurate long-read sequencing (HiFi)을 활용하여

complete 수준의 genome assemble 및 full-length 16S sequencing,

shotgun sequencing 을 통한 종 수준의 분류와 genome profiling, assembly 등

보다 다양하고 깊이 있는 연구를 진행할 수 있습니다

미생물 집단이 인간의 건강에 어떻게 영향을 미치는지 보다 더 잘 이해하기 위해서는 Strain 수준의 미생물 프로파일링이 필요합니다.

rRNA gene amplicon을 이용한 미생물 프로파일링은 빠르고 적은 비용으로 할 수 있어 널리 알려진 방법이지만, 현재 사용되고 있는 short-read 16S rRNA 방법은 일반적으로 근접한 연관 관계에 있는 변종을 구별할 수 없습니다. 

“Shoreline Complete Strain ID Kit”는 16S-23S long amplicon을 구성하여 PacBio사의 Sequel system에 적용, High throughput으로 빠르게 rRNA 유전자를 분석, Strain 수준의 분류를 할 수 있습니다.

Lysis 부터 DNA추출, 긴 amplicon primers 및 database를 포함한 분석 소프트웨어까지 제공함으로써 근접 관계에 있는 미생물 strain도 구별할 수 있습니다.