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Beacon Opto Plasma B Discovery 4.0 Workflow로 신속하게 스크리닝하세요

2021-09-27 15:37:00

 

항체는 새로운 질병 치료 이외에도 암, 자가 면역 질환, 독소, 광견병 바이러스 그리고 홍역과 같이 예기치 않게 재유행하는 바이러스를 치료하는 중요한 생물 치료요법입니다.

 

Beacon platform의 B cell antibody discovery workflow는 바이러스 중화 및 새로운 병원체 치료 응용 분야에 특히 효과적입니다. 

 

 

 

 Beacon® optofluidic 시스템의 Opto Plasma B Discovery 4.0 Workflow로  B세포 레퍼토리의 기능적 프로파일링을 진행,  까다로운 표적에 대한 선도물질을 빠르게 찾아낼 수 있습니다. 이 워크플로우는 단 1주 만에 다음을 수행할 수 있습니다.


• 최대 100,000개의 plasma B 세포에서 1,000개의 hit 회수

• 기능적 프로파일링을 통한 선도 후보물질 down-selection

• 1,000개 이상의 기능성 항체의 시퀀싱 및 re-expression

 

 

 

 

 

WORKFLOW OVERVIEW

Opto Plasma B Discovery 4.0 Workflow로 기능성 항체의 발견, 회수, 시퀀싱 및 재발현을 위해 plasma B 세포를 1주일 안에 신속하게 스크리닝할 수 있습니다.    


이 워크플로우는 Opto Plasma B Discovery 1.0 및 2.0 워크플로우에 비해 스크리닝 처리량이 약 2배 증가하고 hit 회수량이 10배 이상 증가합니다. 




PLASMA B CELL FUNCTIONAL PROFILING

하나의 automated  4-chip 워크플로우에서 최대 50,000개의 plasma B cell을 screening할 수 있고 5,000개 이상의 hit를 감지할 수 있습니다. 

 

 


수 시간 내에 항체 특이성, 교차 반응성, 그리고 soluble- 또는 cell membrane-antigen에 대한 기능을 multiple assay를 활용해 분석할 수 있습니다. 

 

 

 

SEQUENCE RECOVERY 

 

OptoSeq™ Barcode BCR 기술을 사용하면 수천 개의 항체를 한 번에 빠르고 효율적으로 시퀀싱 할 수 있습니다. 항체 염기서열은 최대 12개의barcode가 포함된 bead mixture를 사용하여 대량으로 회수됩니다

 

 

 


 

 

 

OptoSeq Barcoded BCR은 DNA fragmentation, NGS sequencing 그리고 bioinformatics 분석을 거쳐  paired heavy/light chain 항체 유전자의 빠르고 정확한 시퀀싱을 가능하게 합니다.

 

 

 

하나의 96-well plate에서 500개 이상의 항체의 paired heavy/light chain 시퀀스가 높은 효율(73%)로 회수 되었습니다.

 

 

RAPID RE-EXPRESSION

 

Opto BCR Rapid Re-expression kit로 항체를  단 1주일 만에 재발현하여 기능을 확인할 수 있습니다.

  

 

재발현된 항체의 85% 이상(n = 271)은 ELISA assay에서도 확인이 되었습니다.

 

Opto Plasma B Discovery 4.0 Workflow는 단 1주일 만에 최대 100,000개의 plasma B 세포를 screening하고, functional profiling을 통해 선도 물질 후보를 down-selection하며 1,000개 이상의 기능성 항체를 시퀀싱 및 재발현함으로써 1,000개 이상의 hit를 회수할 수 있습니다. 높은 처리량의 시퀀싱과 신속한 재발현과정을 통해 B 세포 레퍼토리의 functional profiling을 통합시킴으로써, 이 워크플로우는 까다로운 표적에 선도물질의 발견을 가속화할 것입니다.

 

 

 

 

  Application Note  

 

하이브리드도마 방법으로는 접근할 수 없었던 membrane targets에 대한 선도물질 (lead molecule) 발견



APPLICATION SPOTLIGHT


• Discover up to 10-fold more hits against soluble and cell membrane antigens in days not weeks

• Generate diverse lead panels by sampling >50-fold greater sequence diversity

• Increase campaign yield and efficiency to reduce costs by 20-fold



 

 

Opto Plasma B Discovery 워크플로우가 어떻게 까다로운 membrane-bound target에 대한 hit recovery를 증가시키고 hybridoma 워크플로우보다 50배 이상 더 다양한 시퀀스에 접근할 수 있는지 확인하실 수 있습니다. 선도물질은 soluble 및 cell membrane 형태의 target antigen 모두에 결합하는 항체를 찾아내기 위해 on-chip assay를 통해 선별되었습니다

 



 

 

Antibody screening Assay :

 

 

Antibody screening Assay :


 

More hits in less time


Opto Plasma B Discovery Workflow는 soluble TIM-3 antigen에 대한 hybridoma 워크플로우의 약 8배의 hit와 cell membrane TIM-3에 특정한 항체의 9배를 발견했습니다. Opto Plasma B Discovery Workflow는 soluble- 및 cell membrane- TIM-3와 교차 반응(cross-react)하는 327개의 항체를 생성한 반면, hybridoma Workflow는 57개의 교차 반응 항체만을 생성했습니다. 더 많은 hit를 발견할 수 있는 능력은 성공적인 선도물질을 감지할 확률을 높입니다.